Tudo começou no início dos anos 90 quando um avião caiu no bairro onde a família Pimentel morava com este acontecimento a família veio morar no conjunto Marcos Freire.
Como ficavam distantes da Igreja Batista do Jardim Ipanema onde eram membros tiveram a iniciativa de abrir um ponto de pregação na própria residência por um período, até que através do irmão Urias Xavier de Mendonça resolveram comprar um terreno para ser a sede de uma congregação.
A Igreja Batista do Conjunto Marcos Freire foi organizada em 27 de janeiro de 1996 com apenas 37 membros com sede e foro na cidade de Guarulhos, à Rua Joaquim Moreira n°181, no Parque São Miguel, SP.
O primeiro presidente foi o pastor Valmir Neres da Silva, que permaneceu no cargo até 8 de setembro de 1996, assumindo então a presidência seu fundador Urias Xavier de Mendonça no dia 14 de dezembro de 1996 assumiu a presidência o pastor Gerson Gomes de Barros.
Seu fundador foi o evangelista Urias Xavier de Mendonça, que acumulava o cargo de vice presidente, como 2° vice presidente a irmã Célia Maria de Melo Pimentel e 1° secretária Sandra de Lima.
Em Fevereiro de 1999 o pastor Gerson pediu exoneração assumindo como presidenta provisória a irmã Célia que dirigiu a igreja até junho de 1999, a partir daí o pastor Aílton de Araújo Vieira assumiu a Igreja permanecendo até hoje.
O 1° estatuto da Igreja foi feito em 7 de junho de 1997 sob a presidência do pastor Gerson Gomes de Barros, com as mudanças do código civil em 12 de dezembro de 2003 sob a presidência já do pastor Ailton foi feita uma pequena mudança no mesmo.
A assembléia administrativa é o poder máximo da igreja, anualmente reuni-se em assembléia extraordinária e elege entre seus membros civilmente capazes uma diretoria :
Presidente
Vice presidente
2° Vice presidente
1° Secretária
2° Secretária
Tesoureiro
2° Tesoureiro
3 Auditores
1 Analista Financeiro
2 Conselheiros.
O rol da igreja atual é de 161 membros legais e conta hoje com 25 ministérios que são:
MSI
LOUVOR
ORAÇÃO
TESOURARIA
KIDS
FINANÇAS
RECEPÇÃO
FIRMADOS NA ROCHA
MARKETING
SIRVO
SIRVINHO
MANUTENÇÃO
PATRIMÕNIO
VISITAÇÃO
SECRETARIA
PEQUENOS GRUPOS
SERVIÇO SOCIAL
EBD
INTEGRAÇÃO AUDITORIA
QAS
DCD
TEATRO
EVANGELIZAÇÃO
Os trabalhos permanentes são:
Cultos dominicais sendo o primeiro as 17:00 horas e o segundo culto as 19:00 horas.
Estudos bíblicos às quartas-feiras 20:00 horas.
Reuniões de oração ás quintas 20:00 horas.
Cultos nos lares.
O propósito da igreja é: TRANS-FORMAR HOMENS EM MINISTROS
No dia 01 de março de 2009 em assembléia foi aprovada a extensão da igreja para o Jardim Recanto Primavera em Arujá, o n° de freqüentadores lá por enquanto é de mais ou menos 30 pessoas por domingo.